代码文档和操作指南是软件著作权申请中的重要组成部分，它们需要包含以下内容：

一、代码文档

1. 文档开头部分

2. 软件名称和版本号：明确标识所申请软件著作权的软件名称和具体版本号，需与申请表中的信息一致。

3. 开发语言：说明软件所使用的开发语言，例如 Java、Python、C++ 等。

4. 主体内容

5. 总体架构：描述软件的整体架构设计，包括各个模块之间的关系和交互方式。可以使用流程图、模块图等方式进行直观展示。

6. 模块功能描述：对软件中的各个主要模块进行详细的功能说明。包括每个模块的输入、输出、处理逻辑以及与其他模块的接口等。

7. 关键算法和数据结构：如果软件中使用了特定的关键算法或复杂的数据结构，应进行详细的解释和说明。包括算法的原理、实现步骤以及数据结构的定义和使用方法。

8. 代码示例：可以选取一些关键的代码片段进行示例说明，帮助审查人员更好地理解软件的实现方式。在代码示例中，应添加适当的注释，解释代码的功能和作用。

9. 结尾部分

10. 文档修订历史：记录文档的修订时间、修订人以及修订内容，以便审查人员了解文档的更新情况。

11. 参考文献（如果有）：列出在编写代码文档过程中参考的相关文献资料。

二、操作指南

1. 文档开头部分

2. 软件名称和版本号：与代码文档一致，明确软件的名称和版本号。

3. 适用范围：说明操作指南所适用的软件版本和用户群体。

4. 主体内容

5. 软件安装：详细介绍软件的安装步骤，包括系统要求、安装文件获取方式、安装过程中的注意事项等。

6. 软件界面介绍：对软件的主要界面进行截图和说明，包括菜单栏、工具栏、操作区域等各个部分的功能和用途。

7. 功能操作说明：按照软件的功能模块，逐一介绍各个功能的操作方法和流程。包括如何启动功能、输入参数的要求、操作步骤以及结果的展示方式等。对于复杂的功能，可以使用流程图或示例进行说明。

8. 常见问题解答：列出用户在使用软件过程中可能遇到的常见问题，并提供相应的解决方法。

9. 结尾部分

10. 技术支持信息：提供软件的技术支持联系方式，如邮箱、电话等，以便用户在遇到问题时能够及时获得帮助。

11. 文档修订历史：记录操作指南的修订时间、修订人以及修订内容。